Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Hoxd13P70217 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Hoxd13P70217 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Hoxd13P70217 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hoxd13P70217 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hoxd13P70217 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hoxd13P70217 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hoxd13P70217 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hoxd13P70217 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxd13P70217 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Hoxd13P70217 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Hoxd13P70217 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Hoxd13P70217 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Hoxd13P70217 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Hoxd13P70217 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Hoxd13P70217 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Hoxd13P70217 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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