Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PlnP61014 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PlnP61014 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
PlnP61014 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
PlnP61014 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PlnP61014 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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PlnP61014 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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PlnP61014 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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PlnP61014 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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PlnP61014 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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PlnP61014 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PlnP61014 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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PlnP61014 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PlnP61014 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PlnP61014 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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PlnP61014 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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