Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms