Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Strn4P58404 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Strn4P58404 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Strn4P58404 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Strn4P58404 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Strn4P58404 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Strn4P58404 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Strn4P58404 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Strn4P58404 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Strn4P58404 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Strn4P58404 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Strn4P58404 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Strn4P58404 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Strn4P58404 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Strn4P58404 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Strn4P58404 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Strn4P58404 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Strn4P58404 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Strn4P58404 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Strn4P58404 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Strn4P58404 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Strn4P58404 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms