Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TdgP56581 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TdgP56581 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TdgP56581 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TdgP56581 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TdgP56581 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TdgP56581 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TdgP56581 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TdgP56581 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdgP56581 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdgP56581 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdgP56581 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdgP56581 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdgP56581 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TdgP56581 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdgP56581 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdgP56581 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdgP56581 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdgP56581 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdgP56581 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdgP56581 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdgP56581 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdgP56581 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdgP56581 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdgP56581 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdgP56581 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdgP56581 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdgP56581 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdgP56581 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdgP56581 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdgP56581 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms