Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms