Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrlP54846 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrlP54846 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NrlP54846 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NrlP54846 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NrlP54846 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NrlP54846 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NrlP54846 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NrlP54846 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NrlP54846 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms