Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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