Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psen1P49769 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psen1P49769 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms