Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpreP49446 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PtpreP49446 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpreP49446 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpreP49446 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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