Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms