Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syt1P46096 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Syt1P46096 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syt1P46096 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syt1P46096 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms