Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ItgavP43406 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ItgavP43406 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ItgavP43406 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ItgavP43406 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ItgavP43406 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ItgavP43406 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ItgavP43406 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ItgavP43406 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ItgavP43406 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ItgavP43406 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ItgavP43406 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ItgavP43406 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ItgavP43406 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ItgavP43406 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ItgavP43406 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ItgavP43406 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms