Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms