Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VhlP40338 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms