Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf1P39428 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf1P39428 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf1P39428 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf1P39428 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf1P39428 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf1P39428 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf1P39428 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf1P39428 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf1P39428 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf1P39428 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf1P39428 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms