Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtlP38585 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtlP38585 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtlP38585 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtlP38585 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtlP38585 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TtlP38585 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtlP38585 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtlP38585 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtlP38585 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtlP38585 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms