Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprkP35822 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprkP35822 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprkP35822 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprkP35822 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprkP35822 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprkP35822 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprkP35822 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprkP35822 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms