Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin1P35438 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin1P35438 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms