Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms