Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms