Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnd1P30999 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms