Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms