Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrgP28705 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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