Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Marcksl1P28667 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms