Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Hoxd10P28359 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Hoxd10P28359 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Hoxd10P28359 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Hoxd10P28359 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Hoxd10P28359 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Hoxd10P28359 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Hoxd10P28359 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Hoxd10P28359 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Hoxd10P28359 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Hoxd10P28359 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Hoxd10P28359 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Hoxd10P28359 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Hoxd10P28359 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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