Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms