Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tsta3P23591 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms