Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PparaP23204 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PparaP23204 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PparaP23204 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PparaP23204 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PparaP23204 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PparaP23204 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PparaP23204 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PparaP23204 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PparaP23204 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PparaP23204 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PparaP23204 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PparaP23204 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PparaP23204 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PparaP23204 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PparaP23204 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PparaP23204 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PparaP23204 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PparaP23204 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PparaP23204 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PparaP23204 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PparaP23204 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PparaP23204 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PparaP23204 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PparaP23204 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PparaP23204 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PparaP23204 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PparaP23204 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PparaP23204 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PparaP23204 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PparaP23204 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PparaP23204 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PparaP23204 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PparaP23204 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PparaP23204 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PparaP23204 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PparaP23204 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PparaP23204 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PparaP23204 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PparaP23204 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PparaP23204 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PparaP23204 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PparaP23204 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PparaP23204 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PparaP23204 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PparaP23204 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PparaP23204 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PparaP23204 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PparaP23204 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PparaP23204 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PparaP23204 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PparaP23204 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PparaP23204 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PparaP23204 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PparaP23204 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PparaP23204 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PparaP23204 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PparaP23204 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PparaP23204 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PparaP23204 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PparaP23204 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PparaP23204 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PparaP23204 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PparaP23204 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PparaP23204 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PparaP23204 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PparaP23204 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PparaP23204 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PparaP23204 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PparaP23204 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PparaP23204 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms