Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou3f1P21952 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms