Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NelfeP19426 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NelfeP19426 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NelfeP19426 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NelfeP19426 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NelfeP19426 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms