Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Hoxb1P17919 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Hoxb1P17919 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb1P17919 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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