Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms