Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prf1P10820 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prf1P10820 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prf1P10820 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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