Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Schip1P0DPB4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Schip1P0DPB4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms