Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Becn2P0DM65 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Becn2P0DM65 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Becn2P0DM65 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Becn2P0DM65 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Becn2P0DM65 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Becn2P0DM65 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Becn2P0DM65 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Becn2P0DM65 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Becn2P0DM65 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Becn2P0DM65 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms