Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LtaP09225 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LtaP09225 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LtaP09225 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LtaP09225 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtaP09225 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtaP09225 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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