Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms