Protein–RNA interactions for Protein: P01786

Ig heavy chain V region MOPC 47A, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01786 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01786 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01786 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01786 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01786 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01786 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01786 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01786 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01786 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01786 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01786 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01786 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms