Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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