Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nptx2O70340 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms