Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms