Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptpn20O55082 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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