Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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