Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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