Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops5O35864 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops5O35864 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops5O35864 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops5O35864 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops5O35864 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops5O35864 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops5O35864 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops5O35864 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops5O35864 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops5O35864 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops5O35864 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops5O35864 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops5O35864 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops5O35864 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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