Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx1aO35526 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms