Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc27a2O35488 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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