Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pitx3O35160 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms