Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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H2-Q1O19441 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Q1O19441 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Q1O19441 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Q1O19441 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Q1O19441 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Q1O19441 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Q1O19441 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Q1O19441 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Q1O19441 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Q1O19441 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Q1O19441 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Q1O19441 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Q1O19441 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Q1O19441 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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H2-Q1O19441 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Q1O19441 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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H2-Q1O19441 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Q1O19441 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Q1O19441 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Q1O19441 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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H2-Q1O19441 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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H2-Q1O19441 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
H2-Q1O19441 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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H2-Q1O19441 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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H2-Q1O19441 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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H2-Q1O19441 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Q1O19441 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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